HealthImaging esempi utilizzando AWS CLI - AWS Command Line Interface
Azioni

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HealthImaging esempi utilizzando AWS CLI

I seguenti esempi di codice mostrano come eseguire azioni e implementare scenari comuni utilizzando AWS Command Line Interface with HealthImaging.

Le azioni sono estratti di codice da programmi più grandi e devono essere eseguite nel contesto. Sebbene le azioni mostrino come richiamare le singole funzioni del servizio, è possibile visualizzarle contestualizzate negli scenari correlati.

Ogni esempio include un link al codice sorgente completo, in cui vengono fornite le istruzioni su come configurare ed eseguire il codice nel contesto.

Argomenti

Azioni

Il seguente esempio di codice mostra come utilizzarecopy-image-set.

AWS CLI

Esempio 1: come copiare un set di immagini senza una destinazione.

L’esempio copy-image-set seguente crea una copia duplicata di un set di immagini senza una destinazione.

aws medical-imaging copy-image-set \
    --datastore-id 12345678901234567890123456789012 \
    --source-image-set-id ea92b0d8838c72a3f25d00d13616f87e \
    --copy-image-set-information '{"sourceImageSet": {"latestVersionId": "1" } }'

Output:

{
    "destinationImageSetProperties": {
        "latestVersionId": "2",
        "imageSetWorkflowStatus": "COPYING",
        "updatedAt": 1680042357.432,
        "imageSetId": "b9a06fef182a5f992842f77f8e0868e5",
        "imageSetState": "LOCKED",
        "createdAt": 1680042357.432
    },
    "sourceImageSetProperties": {
        "latestVersionId": "1",
        "imageSetWorkflowStatus": "COPYING_WITH_READ_ONLY_ACCESS",
        "updatedAt": 1680042357.432,
        "imageSetId": "ea92b0d8838c72a3f25d00d13616f87e",
        "imageSetState": "LOCKED",
        "createdAt": 1680027126.436
    },
    "datastoreId": "12345678901234567890123456789012"
}

Esempio 2: come copiare un set di immagini con una destinazione.

L’esempio copy-image-set seguente crea una copia duplicata di un set di immagini con una destinazione.

aws medical-imaging copy-image-set \
    --datastore-id 12345678901234567890123456789012 \
    --source-image-set-id ea92b0d8838c72a3f25d00d13616f87e \
    --copy-image-set-information '{"sourceImageSet": {"latestVersionId": "1" }, "destinationImageSet": { "imageSetId": "b9a06fef182a5f992842f77f8e0868e5", "latestVersionId": "1"} }'

Output:

{
    "destinationImageSetProperties": {
        "latestVersionId": "2",
        "imageSetWorkflowStatus": "COPYING",
        "updatedAt": 1680042505.135,
        "imageSetId": "b9a06fef182a5f992842f77f8e0868e5",
        "imageSetState": "LOCKED",
        "createdAt": 1680042357.432
    },
    "sourceImageSetProperties": {
        "latestVersionId": "1",
        "imageSetWorkflowStatus": "COPYING_WITH_READ_ONLY_ACCESS",
        "updatedAt": 1680042505.135,
        "imageSetId": "ea92b0d8838c72a3f25d00d13616f87e",
        "imageSetState": "LOCKED",
        "createdAt": 1680027126.436
    },
    "datastoreId": "12345678901234567890123456789012"
}

Esempio 3: come copiare un sottoinsieme di istanze da un set di immagini di origine a un set di immagini di destinazione.

L’esempio copy-image-set seguente copia un’istanza DICOM dal set di immagini di origine nel set di immagini di destinazione. Il parametro force viene fornito per eseguire l’override delle incongruenze a livello degli attributi Patient, Study e Series.

aws medical-imaging copy-image-set \
    --datastore-id 12345678901234567890123456789012 \
    --source-image-set-id ea92b0d8838c72a3f25d00d13616f87e \
    --copy-image-set-information '{"sourceImageSet": {"latestVersionId": "1","DICOMCopies": {"copiableAttributes": "{\"SchemaVersion\":\"1.1\",\"Study\":{\"Series\":{\"1.3.6.1.4.1.5962.99.1.3673257865.2104868982.1369432891697.3666.0\":{\"Instances\":{\"1.3.6.1.4.1.5962.99.1.3673257865.2104868982.1369432891697.3669.0\":{}}}}}}"}},"destinationImageSet": {"imageSetId": "b9eb50d8ee682eb9fcf4acbf92f62bb7","latestVersionId": "1"}}' \
    --force

Output:

{
    "destinationImageSetProperties": {
        "latestVersionId": "2",
        "imageSetWorkflowStatus": "COPYING",
        "updatedAt": 1680042505.135,
        "imageSetId": "b9eb50d8ee682eb9fcf4acbf92f62bb7",
        "imageSetState": "LOCKED",
        "createdAt": 1680042357.432
    },
    "sourceImageSetProperties": {
        "latestVersionId": "1",
        "imageSetWorkflowStatus": "COPYING_WITH_READ_ONLY_ACCESS",
        "updatedAt": 1680042505.135,
        "imageSetId": "ea92b0d8838c72a3f25d00d13616f87e",
        "imageSetState": "LOCKED",
        "createdAt": 1680027126.436
    },
    "datastoreId": "12345678901234567890123456789012"
}

Per ulteriori informazioni, consulta Copiare un set di immagini nella Guida per gli AWS HealthImaging sviluppatori.

Il seguente esempio di codice mostra come utilizzarecreate-datastore.

AWS CLI

Esempio 1: per creare un archivio dati

L’esempio di codice create-datastore seguente crea un datastore denominato my-datastore. Quando si crea un datastore senza specificare a--lossless-storage-format, il AWS HealthImaging valore predefinito è HTJ2 K (High Throughput JPEG 2000).

aws medical-imaging create-datastore \
    --datastore-name "my-datastore"

Output:

{
    "datastoreId": "12345678901234567890123456789012",
    "datastoreStatus": "CREATING"
}

Esempio 2: creare un archivio dati con il formato di archiviazione JPEG 2000 Lossless

Un data store configurato con il formato di archiviazione JPEG 2000 Lossless transcodificherà e renderà persistenti i frame di immagine senza perdita di dati in formato JPEG 2000. I fotogrammi delle immagini possono quindi essere recuperati in JPEG 2000 Lossless senza transcodifica. Il seguente esempio di create-datastore codice crea un archivio dati configurato per il formato di archiviazione JPEG 2000 Lossless con il nome. my-datastore

aws medical-imaging create-datastore \
    --datastore-name "my-datastore" \
    --lossless-storage-format JPEG_2000_LOSSLESS

Output:

{
    "datastoreId": "12345678901234567890123456789012",
    "datastoreStatus": "CREATING"
}

Per ulteriori informazioni, consulta Creazione di un data store nella AWS HealthImaging Developer Guide.

Il seguente esempio di codice mostra come utilizzaredelete-datastore.

AWS CLI

Come eliminare un datastore

L’esempio di codice delete-datastore seguente elimina un datastore.

aws medical-imaging delete-datastore \
    --datastore-id "12345678901234567890123456789012"

Output:

{
    "datastoreId": "12345678901234567890123456789012",
    "datastoreStatus": "DELETING"
}

Per ulteriori informazioni, consulta Eliminazione di un data store nella Guida per gli AWS HealthImaging sviluppatori.

Il seguente esempio di codice mostra come utilizzaredelete-image-set.

AWS CLI

Come eliminare un set di immagini

L’esempio di codice delete-image-set seguente elimina un set di immagini.

aws medical-imaging delete-image-set \
    --datastore-id 12345678901234567890123456789012 \
    --image-set-id ea92b0d8838c72a3f25d00d13616f87e

Output:

{
    "imageSetWorkflowStatus": "DELETING",
    "imageSetId": "ea92b0d8838c72a3f25d00d13616f87e",
    "imageSetState": "LOCKED",
    "datastoreId": "12345678901234567890123456789012"
}

Per ulteriori informazioni, consulta Eliminazione di un set di immagini nella Guida per gli AWS HealthImaging sviluppatori.

Il seguente esempio di codice mostra come utilizzareget-datastore.

AWS CLI

Esempio 1: per ottenere le proprietà di un archivio dati

L’esempio di codice get-datastore seguente ottiene le proprietà di un datastore.

aws medical-imaging get-datastore \
    --datastore-id 12345678901234567890123456789012

Output:

{
    "datastoreProperties": {
        "datastoreId": "12345678901234567890123456789012",
        "datastoreName": "TestDatastore123",
        "datastoreStatus": "ACTIVE",
        "losslessStorageFormat": "HTJ2K"
        "datastoreArn": "arn:aws:medical-imaging:us-east-1:123456789012:datastore/12345678901234567890123456789012",
        "createdAt": "2022-11-15T23:33:09.643000+00:00",
        "updatedAt": "2022-11-15T23:33:09.643000+00:00"
    }
}

Esempio 2: per configurare le proprietà del data store per JPEG2 000

Il seguente esempio di get-datastore codice ottiene le proprietà di un data store per un data store configurato per il formato di archiviazione JPEG 2000 Lossless.

aws medical-imaging get-datastore \
    --datastore-id 12345678901234567890123456789012

Output:

{
    "datastoreProperties": {
        "datastoreId": "12345678901234567890123456789012",
        "datastoreName": "TestDatastore123",
        "datastoreStatus": "ACTIVE",
        "losslessStorageFormat": "JPEG_2000_LOSSLESS",
        "datastoreArn": "arn:aws:medical-imaging:us-east-1:123456789012:datastore/12345678901234567890123456789012",
        "createdAt": "2022-11-15T23:33:09.643000+00:00",
        "updatedAt": "2022-11-15T23:33:09.643000+00:00"
    }
}

Per ulteriori informazioni, consulta Ottenere le proprietà del data store nella AWS HealthImaging Developer Guide.

Il seguente esempio di codice mostra come utilizzareget-dicom-import-job.

AWS CLI

Come ottenere le proprietà di un processo di importazione DICOM

L’esempio di codice get-dicom-import-job seguente concede l’autorizzazione ad avviare un processo di importazione DICOM.

aws medical-imaging get-dicom-import-job \
    --datastore-id "12345678901234567890123456789012" \
    --job-id "09876543210987654321098765432109"

Output:

{
    "jobProperties": {
        "jobId": "09876543210987654321098765432109",
        "jobName": "my-job",
        "jobStatus": "COMPLETED",
        "datastoreId": "12345678901234567890123456789012",
        "dataAccessRoleArn": "arn:aws:iam::123456789012:role/ImportJobDataAccessRole",
        "endedAt": "2022-08-12T11:29:42.285000+00:00",
        "submittedAt": "2022-08-12T11:28:11.152000+00:00",
        "inputS3Uri": "s3://medical-imaging-dicom-input/dicom_input/",
        "outputS3Uri": "s3://medical-imaging-output/job_output/12345678901234567890123456789012-DicomImport-09876543210987654321098765432109/"
    }
}

Per ulteriori informazioni, consulta Ottenere le proprietà dei job di importazione nella AWS HealthImaging Developer Guide.

Il seguente esempio di codice mostra come utilizzareget-image-frame.

AWS CLI

Come ottenere i dati dei pixel del set di immagini

L’esempio di codice get-image-frame seguente ottiene un image frame di immagine.

aws medical-imaging get-image-frame \
    --datastore-id "12345678901234567890123456789012" \
    --image-set-id "98765412345612345678907890789012" \
    --image-frame-information imageFrameId=3abf5d5d7ae72f80a0ec81b2c0de3ef4 \
    imageframe.jph

Nota: questo esempio di codice non include l'output perché l' GetImageFrame azione restituisce un flusso di dati di pixel al file imageframe.jph. Per informazioni sulla decodifica e la visualizzazione dei frame di immagini, vedete K decoding libraries. HTJ2

Per ulteriori informazioni, consultate Ottenere i dati dei pixel del set di immagini nella Guida per gli AWS HealthImaging sviluppatori.

Il seguente esempio di codice mostra come utilizzareget-image-set-metadata.

AWS CLI

Esempio 1: come ottenere i metadati del set di immagini senza versione

L’esempio di codice get-image-set-metadata seguente ottiene i metadati per un set di immagini senza specificare una versione.

Nota: outfile è un parametro obbligatorio.

aws medical-imaging get-image-set-metadata \
    --datastore-id 12345678901234567890123456789012 \
    --image-set-id ea92b0d8838c72a3f25d00d13616f87e \
    studymetadata.json.gz

I metadati restituiti vengono compressi con gzip e archiviati nel file studymetadata.json.gz. Per visualizzare il contenuto dell’oggetto JSON restituito, devi prima decomprimerlo.

Output:

{
    "contentType": "application/json",
    "contentEncoding": "gzip"
}

Esempio 2: come ottenere i metadati del set di immagini con versione

L’esempio di codice get-image-set-metadata seguente ottiene i metadati per un set di immagini con una versione specificata.

Nota: outfile è un parametro obbligatorio.

aws medical-imaging get-image-set-metadata \
    --datastore-id 12345678901234567890123456789012 \
    --image-set-id ea92b0d8838c72a3f25d00d13616f87e \
    --version-id 1 \
    studymetadata.json.gz

I metadati restituiti vengono compressi con gzip e archiviati nel file studymetadata.json.gz. Per visualizzare il contenuto dell’oggetto JSON restituito, devi prima decomprimerlo.

Output:

{
    "contentType": "application/json",
    "contentEncoding": "gzip"
}

Per ulteriori informazioni, consulta Ottenere i metadati dei set di immagini nella Guida per gli AWS HealthImaging sviluppatori.

Il seguente esempio di codice mostra come utilizzareget-image-set.

AWS CLI

Come ottenere le proprietà del set di immagini

L’esempio di codice get-image-set seguente ottiene le proprietà di un set di immagini.

aws medical-imaging get-image-set \
    --datastore-id 12345678901234567890123456789012 \
    --image-set-id 18f88ac7870584f58d56256646b4d92b \
    --version-id 1

Output:

{
    "versionId": "1",
    "imageSetWorkflowStatus": "COPIED",
    "updatedAt": 1680027253.471,
    "imageSetId": "18f88ac7870584f58d56256646b4d92b",
    "imageSetState": "ACTIVE",
    "createdAt": 1679592510.753,
    "datastoreId": "12345678901234567890123456789012"
}

Per ulteriori informazioni, consulta Ottenere le proprietà del set di immagini nella Guida per gli AWS HealthImaging sviluppatori.

Il seguente esempio di codice mostra come utilizzarelist-datastores.

AWS CLI

Come elencare i datastore

L’esempio di codice list-datastores seguente elenca i datastore disponibili.

aws medical-imaging list-datastores

Output:

{
    "datastoreSummaries": [
        {
            "datastoreId": "12345678901234567890123456789012",
            "datastoreName": "TestDatastore123",
            "datastoreStatus": "ACTIVE",
            "datastoreArn": "arn:aws:medical-imaging:us-east-1:123456789012:datastore/12345678901234567890123456789012",
            "createdAt": "2022-11-15T23:33:09.643000+00:00",
            "updatedAt": "2022-11-15T23:33:09.643000+00:00"
        }
    ]
}

Per ulteriori informazioni, consulta Elencare gli archivi di dati nella Guida per gli AWS HealthImaging sviluppatori.

Il seguente esempio di codice mostra come utilizzarelist-dicom-import-jobs.

AWS CLI

Come elencare i processi di importazione DICOM

L’esempio di codice list-dicom-import-jobs seguente elenca i processi di importazione DICOM.

aws medical-imaging list-dicom-import-jobs \
    --datastore-id "12345678901234567890123456789012"

Output:

{
    "jobSummaries": [
        {
            "jobId": "09876543210987654321098765432109",
            "jobName": "my-job",
            "jobStatus": "COMPLETED",
            "datastoreId": "12345678901234567890123456789012",
            "dataAccessRoleArn": "arn:aws:iam::123456789012:role/ImportJobDataAccessRole",
            "endedAt": "2022-08-12T11:21:56.504000+00:00",
            "submittedAt": "2022-08-12T11:20:21.734000+00:00"
        }
    ]
}

Per ulteriori informazioni, consulta Elencare i lavori di importazione nella Guida per gli AWS HealthImaging sviluppatori.

Il seguente esempio di codice mostra come utilizzarelist-image-set-versions.

AWS CLI

Come elencare le versioni dei set di immagini

L’esempio di codice list-image-set-versions seguente elenca la cronologia delle versioni di un set di immagini.

aws medical-imaging list-image-set-versions \
    --datastore-id 12345678901234567890123456789012 \
    --image-set-id ea92b0d8838c72a3f25d00d13616f87e

Output:

{
    "imageSetPropertiesList": [
        {
            "ImageSetWorkflowStatus": "UPDATED",
            "versionId": "4",
            "updatedAt": 1680029436.304,
            "imageSetId": "ea92b0d8838c72a3f25d00d13616f87e",
            "imageSetState": "ACTIVE",
            "createdAt": 1680027126.436
        },
        {
            "ImageSetWorkflowStatus": "UPDATED",
            "versionId": "3",
            "updatedAt": 1680029163.325,
            "imageSetId": "ea92b0d8838c72a3f25d00d13616f87e",
            "imageSetState": "ACTIVE",
            "createdAt": 1680027126.436
        },
        {
            "ImageSetWorkflowStatus": "COPY_FAILED",
            "versionId": "2",
            "updatedAt": 1680027455.944,
            "imageSetId": "ea92b0d8838c72a3f25d00d13616f87e",
            "imageSetState": "ACTIVE",
            "message": "INVALID_REQUEST:  Series of SourceImageSet and DestinationImageSet don't match.",
            "createdAt": 1680027126.436
        },
        {
            "imageSetId": "ea92b0d8838c72a3f25d00d13616f87e",
            "imageSetState": "ACTIVE",
            "versionId": "1",
            "ImageSetWorkflowStatus": "COPIED",
            "createdAt": 1680027126.436
        }
    ]
}

Per ulteriori informazioni, consulta Elenco delle versioni dei set di immagini nella Guida per gli AWS HealthImaging sviluppatori.

Il seguente esempio di codice mostra come utilizzarelist-tags-for-resource.

AWS CLI

Esempio 1: come elencare i tag delle risorse per un datastore

L’esempio di codice list-tags-for-resource seguente elenca i tag di un datastore.

aws medical-imaging list-tags-for-resource \
    --resource-arn "arn:aws:medical-imaging:us-east-1:123456789012:datastore/12345678901234567890123456789012"

Output:

{
    "tags":{
        "Deployment":"Development"
    }
}

Esempio 2: come elencare i tag delle risorse per un set di immagini

L’esempio di codice list-tags-for-resource seguente elenca i tag di un set di immagini.

aws medical-imaging list-tags-for-resource \
    --resource-arn "arn:aws:medical-imaging:us-east-1:123456789012:datastore/12345678901234567890123456789012/imageset/18f88ac7870584f58d56256646b4d92b"

Output:

{
    "tags":{
        "Deployment":"Development"
    }
}

Per ulteriori informazioni, consulta Tagging resources with AWS HealthImaging nella AWS HealthImaging Developer Guide.

Il seguente esempio di codice mostra come utilizzaresearch-image-sets.

AWS CLI

Esempio 1: come cercare set di immagini con un operatore EQUAL

L’esempio di codice search-image-sets seguente utilizza l’operatore EQUAL per cercare set di immagini in base a un valore specifico.

aws medical-imaging search-image-sets \
    --datastore-id 12345678901234567890123456789012 \
    --search-criteria file://search-criteria.json

Contenuto di search-criteria.json

{
    "filters": [{
        "values": [{"DICOMPatientId" : "SUBJECT08701"}],
        "operator": "EQUAL"
    }]
}

Output:

{
    "imageSetsMetadataSummaries": [{
        "imageSetId": "09876543210987654321098765432109",
        "createdAt": "2022-12-06T21:40:59.429000+00:00",
        "version": 1,
        "DICOMTags": {
            "DICOMStudyId": "2011201407",
            "DICOMStudyDate": "19991122",
             "DICOMPatientSex": "F",
             "DICOMStudyInstanceUID": "1.2.840.99999999.84710745.943275268089",
             "DICOMPatientBirthDate": "19201120",
             "DICOMStudyDescription": "UNKNOWN",
             "DICOMPatientId": "SUBJECT08701",
             "DICOMPatientName": "Melissa844 Huel628",
             "DICOMNumberOfStudyRelatedInstances": 1,
             "DICOMStudyTime": "140728",
             "DICOMNumberOfStudyRelatedSeries": 1
            },
        "updatedAt": "2022-12-06T21:40:59.429000+00:00"
    }]
}

Esempio 2: per cercare set di immagini con un operatore BETWEEN utilizzando DICOMStudy Data e DICOMStudy ora

L’esempio search-image-sets seguente cerca set di immagini con studi DICOM generati tra il 1° gennaio 1990 (00:00) e il 1° gennaio 2023 (00:00).

Nota: l'DICOMStudyora è facoltativa. Se non presente, 00:00 (inizio della giornata) è il valore temporale per le date fornite per l’applicazione di filtri.

aws medical-imaging search-image-sets \
    --datastore-id 12345678901234567890123456789012 \
    --search-criteria file://search-criteria.json

Contenuto di search-criteria.json

{
    "filters": [{
        "values": [{
            "DICOMStudyDateAndTime": {
                "DICOMStudyDate": "19900101",
                "DICOMStudyTime": "000000"
            }
        },
        {
            "DICOMStudyDateAndTime": {
                "DICOMStudyDate": "20230101",
                "DICOMStudyTime": "000000"
            }
        }],
        "operator": "BETWEEN"
    }]
}

Output:

{
    "imageSetsMetadataSummaries": [{
        "imageSetId": "09876543210987654321098765432109",
        "createdAt": "2022-12-06T21:40:59.429000+00:00",
        "version": 1,
        "DICOMTags": {
            "DICOMStudyId": "2011201407",
            "DICOMStudyDate": "19991122",
            "DICOMPatientSex": "F",
            "DICOMStudyInstanceUID": "1.2.840.99999999.84710745.943275268089",
            "DICOMPatientBirthDate": "19201120",
            "DICOMStudyDescription": "UNKNOWN",
            "DICOMPatientId": "SUBJECT08701",
            "DICOMPatientName": "Melissa844 Huel628",
            "DICOMNumberOfStudyRelatedInstances": 1,
            "DICOMStudyTime": "140728",
            "DICOMNumberOfStudyRelatedSeries": 1
        },
        "updatedAt": "2022-12-06T21:40:59.429000+00:00"
    }]
}

Esempio 3: come cercare set di immagini con un operatore BETWEEN utilizzando createdAt (in precedenza gli studi temporali erano persistenti)

Il seguente esempio di search-image-sets codice cerca i set di immagini con DICOM Studies persistenti HealthImaging tra gli intervalli di tempo del fuso orario UTC.

Nota: fornisci createdAt nel formato dell’esempio (“1985-04-12T23:20:50.52Z”).

aws medical-imaging search-image-sets \
    --datastore-id 12345678901234567890123456789012 \
    --search-criteria  file://search-criteria.json

Contenuto di search-criteria.json

{
    "filters": [{
        "values": [{
            "createdAt": "1985-04-12T23:20:50.52Z"
        },
        {
            "createdAt": "2022-04-12T23:20:50.52Z"
        }],
        "operator": "BETWEEN"
    }]
}

Output:

{
    "imageSetsMetadataSummaries": [{
        "imageSetId": "09876543210987654321098765432109",
        "createdAt": "2022-12-06T21:40:59.429000+00:00",
        "version": 1,
        "DICOMTags": {
            "DICOMStudyId": "2011201407",
            "DICOMStudyDate": "19991122",
            "DICOMPatientSex": "F",
            "DICOMStudyInstanceUID": "1.2.840.99999999.84710745.943275268089",
            "DICOMPatientBirthDate": "19201120",
            "DICOMStudyDescription": "UNKNOWN",
            "DICOMPatientId": "SUBJECT08701",
            "DICOMPatientName": "Melissa844 Huel628",
            "DICOMNumberOfStudyRelatedInstances": 1,
            "DICOMStudyTime": "140728",
            "DICOMNumberOfStudyRelatedSeries": 1
        },
        "lastUpdatedAt": "2022-12-06T21:40:59.429000+00:00"
    }]
}

Esempio 4: cercare set di immagini con un operatore EQUAL su DICOMSeries instanceUID e BETWEEN su updatedAt e ordinare la risposta in ordine ASC nel campo updatedAt

Il seguente esempio di search-image-sets codice cerca i set di immagini con un operatore EQUAL su DICOMSeries instanceUID e BETWEEN su updatedAt e ordina la risposta in ordine ASC sul campo updatedAt.

Nota: fornisci updatedAt nel formato dell’esempio (“1985-04-12T23:20:50.52Z”).

aws medical-imaging search-image-sets \
    --datastore-id 12345678901234567890123456789012 \
    --search-criteria  file://search-criteria.json

Contenuto di search-criteria.json

{
    "filters": [{
        "values": [{
            "updatedAt": "2024-03-11T15:00:05.074000-07:00"
        }, {
            "updatedAt": "2024-03-11T16:00:05.074000-07:00"
        }],
        "operator": "BETWEEN"
    }, {
        "values": [{
            "DICOMSeriesInstanceUID": "1.2.840.99999999.84710745.943275268089"
        }],
        "operator": "EQUAL"
    }],
    "sort": {
        "sortField": "updatedAt",
        "sortOrder": "ASC"
    }
}

Output:

{
    "imageSetsMetadataSummaries": [{
        "imageSetId": "09876543210987654321098765432109",
        "createdAt": "2022-12-06T21:40:59.429000+00:00",
        "version": 1,
        "DICOMTags": {
            "DICOMStudyId": "2011201407",
            "DICOMStudyDate": "19991122",
            "DICOMPatientSex": "F",
            "DICOMStudyInstanceUID": "1.2.840.99999999.84710745.943275268089",
            "DICOMPatientBirthDate": "19201120",
            "DICOMStudyDescription": "UNKNOWN",
            "DICOMPatientId": "SUBJECT08701",
            "DICOMPatientName": "Melissa844 Huel628",
            "DICOMNumberOfStudyRelatedInstances": 1,
            "DICOMStudyTime": "140728",
            "DICOMNumberOfStudyRelatedSeries": 1
        },
        "lastUpdatedAt": "2022-12-06T21:40:59.429000+00:00"
    }]
}

Per ulteriori informazioni, consulta Searching image sets nella Developer Guide.AWS HealthImaging

Il seguente esempio di codice mostra come utilizzarestart-dicom-import-job.

AWS CLI

Come avviare un processo di importazione DICOM

L’esempio di codice start-dicom-import-job seguente avvia un processo di importazione DICOM.

aws medical-imaging start-dicom-import-job \
    --job-name "my-job" \
    --datastore-id "12345678901234567890123456789012" \
    --input-s3-uri "s3://medical-imaging-dicom-input/dicom_input/" \
    --output-s3-uri "s3://medical-imaging-output/job_output/" \
    --data-access-role-arn "arn:aws:iam::123456789012:role/ImportJobDataAccessRole"

Output:

{
    "datastoreId": "12345678901234567890123456789012",
    "jobId": "09876543210987654321098765432109",
    "jobStatus": "SUBMITTED",
    "submittedAt": "2022-08-12T11:28:11.152000+00:00"
}

Per ulteriori informazioni, consulta Avvio di un processo di importazione nella Guida per gli AWS HealthImaging sviluppatori.

Il seguente esempio di codice mostra come utilizzaretag-resource.

AWS CLI

Esempio 1: come applicare tag a un datastore

L’esempio tag-resource seguente aggiunge tag a un datastore.

aws medical-imaging tag-resource \
  --resource-arn "arn:aws:medical-imaging:us-east-1:123456789012:datastore/12345678901234567890123456789012" \
  --tags '{"Deployment":"Development"}'

Questo comando non produce alcun output.

Esempio 2: come applicare tag a un set di immagini

L’esempio tag-resource seguente tagga un set di immagini.

aws medical-imaging tag-resource \
    --resource-arn "arn:aws:medical-imaging:us-east-1:123456789012:datastore/12345678901234567890123456789012/imageset/18f88ac7870584f58d56256646b4d92b" \
    --tags '{"Deployment":"Development"}'

Questo comando non produce alcun output.

Per ulteriori informazioni, consulta Tagging resources with AWS HealthImaging nella AWS HealthImaging Developer Guide.

Il seguente esempio di codice mostra come utilizzareuntag-resource.

AWS CLI

Esempio 1: come rimuovere i tag da un datastore

L’esempio di codice untag-resource seguente rimuove i tag da un datastore.

aws medical-imaging untag-resource \
    --resource-arn "arn:aws:medical-imaging:us-east-1:123456789012:datastore/12345678901234567890123456789012" \
    --tag-keys '["Deployment"]'

Questo comando non produce alcun output.

Esempio 2: come rimuovere i tag da un set di immagini

L’esempio untag-resource seguente rimuove i tag da un set di immagini.

aws medical-imaging untag-resource \
    --resource-arn "arn:aws:medical-imaging:us-east-1:123456789012:datastore/12345678901234567890123456789012/imageset/18f88ac7870584f58d56256646b4d92b" \
    --tag-keys '["Deployment"]'

Questo comando non produce alcun output.

Per ulteriori informazioni, consulta Tagging resources with AWS HealthImaging nella AWS HealthImaging Developer Guide.

Il seguente esempio di codice mostra come utilizzareupdate-image-set-metadata.

AWS CLI

Esempio 1: come inserire o aggiornare un attributo nei metadati del set di immagini

L’esempio update-image-set-metadata seguente inserisce o aggiorna un attributo nei metadati del set di immagini.

aws medical-imaging update-image-set-metadata \
    --datastore-id 12345678901234567890123456789012 \
    --image-set-id ea92b0d8838c72a3f25d00d13616f87e \
    --latest-version-id 1 \
    --cli-binary-format raw-in-base64-out \
    --update-image-set-metadata-updates file://metadata-updates.json

Contenuto di metadata-updates.json

{
    "DICOMUpdates": {
        "updatableAttributes": "{\"SchemaVersion\":1.1,\"Patient\":{\"DICOM\":{\"PatientName\":\"MX^MX\"}}}"
    }
}

Output:

{
    "latestVersionId": "2",
    "imageSetWorkflowStatus": "UPDATING",
    "updatedAt": 1680042257.908,
    "imageSetId": "ea92b0d8838c72a3f25d00d13616f87e",
    "imageSetState": "LOCKED",
    "createdAt": 1680027126.436,
    "datastoreId": "12345678901234567890123456789012"
}

Esempio 2: come rimuovere un attributo dai metadati del set di immagini

L’esempio update-image-set-metadata seguente rimuove un attributo dai metadati del set di immagini.

aws medical-imaging update-image-set-metadata \
    --datastore-id 12345678901234567890123456789012 \
    --image-set-id ea92b0d8838c72a3f25d00d13616f87e \
    --latest-version-id 1 \
    --cli-binary-format raw-in-base64-out \
    --update-image-set-metadata-updates file://metadata-updates.json

Contenuto di metadata-updates.json

{
    "DICOMUpdates": {
        "removableAttributes": "{\"SchemaVersion\":1.1,\"Study\":{\"DICOM\":{\"StudyDescription\":\"CHEST\"}}}"
    }
}

Output:

{
    "latestVersionId": "2",
    "imageSetWorkflowStatus": "UPDATING",
    "updatedAt": 1680042257.908,
    "imageSetId": "ea92b0d8838c72a3f25d00d13616f87e",
    "imageSetState": "LOCKED",
    "createdAt": 1680027126.436,
    "datastoreId": "12345678901234567890123456789012"
}

Esempio 3: come rimuovere un’istanza dai metadati del set di immagini

L’esempio update-image-set-metadata seguente rimuove un’istanza dai metadati del set di immagini.

aws medical-imaging update-image-set-metadata \
    --datastore-id 12345678901234567890123456789012 \
    --image-set-id ea92b0d8838c72a3f25d00d13616f87e \
    --latest-version-id 1 \
    --cli-binary-format raw-in-base64-out \
    --update-image-set-metadata-updates file://metadata-updates.json

Contenuto di metadata-updates.json

{
    "DICOMUpdates": {
        "removableAttributes": "{\"SchemaVersion\": 1.1,\"Study\": {\"Series\": {\"1.1.1.1.1.1.12345.123456789012.123.12345678901234.1\": {\"Instances\": {\"1.1.1.1.1.1.12345.123456789012.123.12345678901234.1\": {}}}}}}"
    }
}

Output:

{
    "latestVersionId": "2",
    "imageSetWorkflowStatus": "UPDATING",
    "updatedAt": 1680042257.908,
    "imageSetId": "ea92b0d8838c72a3f25d00d13616f87e",
    "imageSetState": "LOCKED",
    "createdAt": 1680027126.436,
    "datastoreId": "12345678901234567890123456789012"
}

Esempio 4: come ripristinare la versione precedente di un set di immagini

L'update-image-set-metadataesempio seguente mostra come ripristinare una versione precedente di un set di immagini. CopyImageSet e UpdateImageSetMetadata le azioni creano nuove versioni dei set di immagini.

aws medical-imaging update-image-set-metadata \
    --datastore-id 12345678901234567890123456789012 \
    --image-set-id 53d5fdb05ca4d46ac7ca64b06545c66e \
    --latest-version-id 3 \
    --cli-binary-format raw-in-base64-out \
    --update-image-set-metadata-updates '{"revertToVersionId": "1"}'

Output:

{
    "datastoreId": "12345678901234567890123456789012",
    "imageSetId": "53d5fdb05ca4d46ac7ca64b06545c66e",
    "latestVersionId": "4",
    "imageSetState": "LOCKED",
    "imageSetWorkflowStatus": "UPDATING",
    "createdAt": 1680027126.436,
    "updatedAt": 1680042257.908
}

Esempio 5: come aggiungere un elemento di dati DICOM privato a un’istanza

L’esempio update-image-set-metadata seguente aggiunge un elemento privato a un’istanza specificata all’interno di un set di immagini. Lo standard DICOM consente di utilizzare elementi di dati privati nella comunicazione di informazioni che non possono essere contenute in elementi di dati standard. È possibile creare, aggiornare ed eliminare elementi di dati privati con l'UpdateImageSetMetadata azione.

aws medical-imaging update-image-set-metadata \
    --datastore-id 12345678901234567890123456789012 \
    --image-set-id 53d5fdb05ca4d46ac7ca64b06545c66e \
    --latest-version-id 1 \
    --cli-binary-format raw-in-base64-out \
    --force \
    --update-image-set-metadata-updates file://metadata-updates.json

Contenuto di metadata-updates.json

{
    "DICOMUpdates": {
        "updatableAttributes": "{\"SchemaVersion\": 1.1,\"Study\": {\"Series\": {\"1.1.1.1.1.1.12345.123456789012.123.12345678901234.1\": {\"Instances\": {\"1.1.1.1.1.1.12345.123456789012.123.12345678901234.1\": {\"DICOM\": {\"001910F9\": \"97\"},\"DICOMVRs\": {\"001910F9\": \"DS\"}}}}}}}"
    }
}

Output:

{
    "latestVersionId": "2",
    "imageSetWorkflowStatus": "UPDATING",
    "updatedAt": 1680042257.908,
    "imageSetId": "53d5fdb05ca4d46ac7ca64b06545c66e",
    "imageSetState": "LOCKED",
    "createdAt": 1680027126.436,
    "datastoreId": "12345678901234567890123456789012"
}

Esempio 6: come aggiornare un elemento di dati DICOM privato a un’istanza

L’esempio update-image-set-metadata seguente aggiorna il valore di un elemento dati privato appartenente a un’istanza all’interno di un set di immagini.

aws medical-imaging update-image-set-metadata \
    --datastore-id 12345678901234567890123456789012 \
    --image-set-id 53d5fdb05ca4d46ac7ca64b06545c66e \
    --latest-version-id 1 \
    --cli-binary-format raw-in-base64-out \
    --force \
    --update-image-set-metadata-updates file://metadata-updates.json

Contenuto di metadata-updates.json

{
    "DICOMUpdates": {
        "updatableAttributes": "{\"SchemaVersion\": 1.1,\"Study\": {\"Series\": {\"1.1.1.1.1.1.12345.123456789012.123.12345678901234.1\": {\"Instances\": {\"1.1.1.1.1.1.12345.123456789012.123.12345678901234.1\": {\"DICOM\": {\"00091001\": \"GE_GENESIS_DD\"}}}}}}}"
    }
}

Output:

{
    "latestVersionId": "2",
    "imageSetWorkflowStatus": "UPDATING",
    "updatedAt": 1680042257.908,
    "imageSetId": "53d5fdb05ca4d46ac7ca64b06545c66e",
    "imageSetState": "LOCKED",
    "createdAt": 1680027126.436,
    "datastoreId": "12345678901234567890123456789012"
}

Esempio 7: aggiornare un SOPInstance UID con il parametro force

L'update-image-set-metadataesempio seguente mostra come aggiornare un SOPInstance UID, utilizzando il parametro force per sovrascrivere i vincoli dei metadati DICOM.

aws medical-imaging update-image-set-metadata \
        --datastore-id 12345678901234567890123456789012 \
        --image-set-id 53d5fdb05ca4d46ac7ca64b06545c66e \
        --latest-version-id 1 \
        --cli-binary-format raw-in-base64-out \
        --force \
        --update-image-set-metadata-updates file://metadata-updates.json

Contenuto di metadata-updates.json

{
    "DICOMUpdates": {
        "updatableAttributes": "{\"SchemaVersion\":1.1,\"Study\":{\"Series\":{\"1.3.6.1.4.1.5962.99.1.3633258862.2104868982.1369432891697.3656.0\":{\"Instances\":{\"1.3.6.1.4.1.5962.99.1.3633258862.2104868982.1369432891697.3659.0\":{\"DICOM\":{\"SOPInstanceUID\":\"1.3.6.1.4.1.5962.99.1.3633258862.2104868982.1369432891697.3659.9\"}}}}}}}"
    }
}

Output:

{
    "latestVersionId": "2",
    "imageSetWorkflowStatus": "UPDATING",
    "updatedAt": 1680042257.908,
    "imageSetId": "53d5fdb05ca4d46ac7ca64b06545c66e",
    "imageSetState": "LOCKED",
    "createdAt": 1680027126.436,
    "datastoreId": "12345678901234567890123456789012"
}

Per ulteriori informazioni, consultate Updating image set metadata nella Developer Guide.AWS HealthImaging